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program mem_pore_pep
use parameters
use proteina
use printout
use guessing
use call_solver
implicit none
integer:: guessx,ier,dimkrlv,mxiter,i,neq,nsol
integer,parameter:: nsolfi=22
real(8):: pHmin,pHmax,dpHmin,dpHmax,dpHstp
real(8):: dpH,pH0,pHvec(2),dpHvec(3)
real(8):: errtol(2),fnorm
real(8),allocatable:: x(:),xg(:),f(:),constr(:)
real:: t_ini,t_fin,dt
character(50):: solfiname
logical:: loopH,goodx
!..........read parameters
call read_param(errtol,dimkrlv,mxiter,guessx,pHvec,dpHvec)
!............................................................
!..... solutions given in "sol-cases.in" file - only calculate free energy and stuff
!............................................................
! Formato de sol-cases.in
! Entero = numero de soluciones a leer
! Nombres de los archivos de solucion uno debajo de otro
! Notar que el archivo de solucion contine los datos del archivo de entrada con que se corrio.
! Ingonara lo que lee de param.in
if (guessx==3) then
open(nsolfi,file="sol-cases.in")
read(nsolfi,*)nsol
do i=1,nsol
read(nsolfi,*)solfiname
call readsol(i,x,neq,solfiname)
if (i==1) call read_peptide(guessx,deltaz,deltar)
! Genera las cantidades de bulk. Ver notas, solo calcula parametros a partir de los inputs
call bulkimeter(vsol,vH,zH,vOH,zOH,vpls,zpls,vmin,zmin,pKw,pH,csalt,&
&xsolbulk,xHbulk,xOHbulk,xplsbulk,xminbulk,rhopbulk,&
&vaa,zaa,pKaa,naac,cnaa,ntyi)
! Procesa los datos.
call freen(x,neq) ! Ahora esta subrutina no es funcional
enddo
close(nsolfi)
write(*,'(/1x5("*")" Ciao!"/)')
stop
endif
call cpu_time(t_ini)
pHmin=pHvec(1)
pHmax=pHvec(2)
dpHmax=dpHvec(1)
dpHmin=dpHvec(2)
dpHstp=dpHvec(3)
if (pHmin>pHmax) dpHstp=-dpHstp
!..........read/generate protein and rotate it
! Lee archivos de entrada del peptido y lo genera con RIS
call read_peptide(guessx,deltaz,deltar)
call get_neq(neq) ! calcula numero de ecuaciones a resolver
allocate(f(neq)) ! f is dummy here
allocate(x(neq))
allocate(xg(neq))
allocate(constr(neq))
call cpu_time(t_fin)
dt=t_fin-t_ini
call print_screen(sim_id,neq,dt)
!................
!..... loop on pH
!................
ier=0
loopH=.true.
pH=pHmin
pH0=0d0
if (pHmin<=pHmax) then
dpH=dpHmax
else
dpH=-dpHmax
endif
do while (loopH)
! Genera las cantidades de bulk. Ver notas, solo calcula parametros a partir de los inputs
call bulkimeter(vsol,vH,zH,vOH,zOH,vpls,zpls,vmin,zmin,pKw,pH,csalt,&
&xsolbulk,xHbulk,xOHbulk,xplsbulk,xminbulk,rhopbulk,&
&vaa,zaa,pKaa,naac,cnaa,ntyi)
write(*,1401)pH,csalt
1401 format(/1x30("*")//1x"...starting calculation with:"/&
&4x"pH:"1xf6.3/4x"csalt:"1xf6.4)
! Guess incial para el solver
call adivinador(guessx,x,xg,constr,neq,pH,pH0) ! guess
guessx=1 ! A partir de aqui se toma la solucion al ph anterior para el nuevo calculo
call cpu_time(t_ini)
! subrutina que llama al solver, devuelve ier=0 si encontro solucion
ier=0
!write(*,*)"STOP"
!stop
call llamador(x,xg,constr,neq,errtol,dimkrlv,mxiter,ier,fnorm) ! solve
call cpu_time(t_fin)
dt=t_fin-t_ini
! Imprime las soluciones (big files) que luego se pueden usar como inputs
call print_xs(ier,fnorm,goodx,neq,x,constr,dt)
if (ier==0.and.goodx) then
! Se llama a esta rutina si se quiere procesar la solucion
call freen(x,neq)
pH0=pH
pH=pH+dpH
else
write(*,'(/1x"...no solution found for pH:",1x,f6.3)')pH
dpH=dpH-dpHstp
pH=pH0+dpH
x=xg
if (pH0==0d0) exit ! firt pH calculation failed
endif
! revisa que este todo bien con el loop en pH
call StayOn_pHloop(pH,pH0,dpH,dpHmin,pHmin,pHmax,loopH)
if (.not.loopH) exit
enddo
!..........
write(*,*)
contains
subroutine stayOn_pHloop(pH,pH0,dpH,dpHmin,pHmin,pHmax,loopH)
implicit none
real(8),intent(in):: pH0,dpH,dpHmin,pHmin,pHmax
real(8),intent(inout):: pH
logical,intent(out):: loopH
loopH=.true.
if (abs(dpH)<dpHmin) loopH=.false.
if (dpH==0d0) then
loopH=.false. ! do not do case again
write(*,*)
write(*,*)" ...pH_step=0 reached"
elseif (dpH<0d0.and.pHmin<pHmax) then
loopH=.false.
write(*,*)
write(*,*)" ...minimum |pH_step| reached"
elseif (dpH>=0.d0.and.pHmin>pHmax) then
loopH=.false.
write(*,*)
write(*,*)" ...minimum |pH_step| reached"
endif
if (pH>pHmax.and.pHmin<=pHmax) then
if (pH0==pHmax) then
loopH=.false.
else
pH=pHmax
endif
endif
if (pH<pHmax.and.pHmin>pHmax) then
if (pH0==pHmax) then
loopH=.false.
else
pH=pHmax
endif
endif
end subroutine stayOn_pHloop
end program mem_pore_pep