docker-containers

A collection of Dockerfiles for bioinformatics tools:

Tools

• FastQC (version 0.11.5)
• edgeR (version 3.20.2)
• Expression Analysis and GFF3 to BED (gff file format conversions)
• gffread (version 0.9.9)
• Picard (version 2.18.9)
• STAR (version 2.5.3a) and HISAT2 (version 2.1.0)
• subread (version 1.6.0)