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# Author: Manuel Jiménez Bernal - manu.asi2@gmail.com
# Iliberi S.A. Granada,Spain - 02/2016
######## SOM GENERATOR ###########
library(png) # For writePNG function
library(kohonen)
library(shiny)
library(ggplot2)
library(jsonlite)
options(shiny.maxRequestSize=500*1024^2)
#Comienzo de la estructura interactiva en el servidor
shinyServer(function(input, output, session) {
#Leer datos desde fichero CSV. Todos los valores deben ser numéricos.
dataInput <- reactive({
inFile <- input$file1
players<-read.csv(inFile$datapath, header=input$header, sep=input$sep,quote=input$quote,stringsAsFactors=FALSE, fileEncoding="latin1")
})
#Función reactiva que genera la estructura del SOM
generaSOM <- reactive({
head(dataInput())
players.sc <- scale(dataInput())
set.seed(15675)
players.som <- som(players.sc, grid = somgrid(input$slider1, input$slider2, input$fig))
})
#Función que genera el gráfico con el resultado del SOM con los distintos parámetros, se utiliza la paleta de colores creada con anterioridad.
#Esta función se realiza aparte con el fin de que sea llamada por los distintos métodos reactivos.
generaGrafico = function(){
if (is.null(input$file1))
return(NULL)
else{
coolBlueHotRed <- function(n, alpha = 1) {
rainbow(n, end=4/6, alpha=alpha)[n:1]
}
plot(generaSOM(),type = input$select, main = "SOM", palette.name = coolBlueHotRed)
}
}
# Función que convierte un objeto de la clase 'kohonen' en una tabla renderizable.
somToTable = function(){
as.table( as.matrix(generaSOM()) )
}
#Envío al UI del renderizado de la gráfica.
output$salida<-renderPlot({
generaGrafico()
},height = 800, width = 800 )
#Manejador para la descarga de la imagen del gráfico.
output$downloadData <- downloadHandler(
filename = "shinyplot.png",
content = function(file) {
png(file,width=800,height=800)
generaGrafico()
dev.off()
})
#Manejador de la descarga de la estructura del SOM en formato CSV
output$downloadTabla <- downloadHandler(
filename = "som.csv",
content = function(file) {
write.table(somToTable(), file, sep = ",",row.names = FALSE)
}
)
output$tabla <- DT::renderDataTable(
if (is.null(input$file1))
return(NULL)
else{
DT::datatable(dataInput(), options = list(searching = FALSE))
}
)
})