Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Marks of reference points on line break in exportAlignmentsPretty #1049

Open
gnefedev opened this issue Mar 21, 2023 · 0 comments
Open

Marks of reference points on line break in exportAlignmentsPretty #1049

gnefedev opened this issue Mar 21, 2023 · 0 comments

Comments

@gnefedev
Copy link
Contributor

               T  V  L  T  S  V  S  R  E  K  K  E  S  F  P  L  T  V  T  S  A  Q  K  N  P  T  A  F  Y  L     
  Quality     666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666    
  Target0   0 ACGGTCCTAACGAGCGTCTCTCGGGAGAAGAAGGAATCCTTTCCTCTCACTGTGACATCGGCCCAAAAGAACCCGACAGCTTTCTATCTC 89   Score
TRBV19*00 349             agcgtctctcgggagaagaaggaatcctttcctctcactgtgacatcggcccaaaagaacccgacagctttctatctc 426  450

               <CDR3     V>   <D    D>  <J          CDR3><FR4                    FR4>                        
                C  A  S  S  P  G  Q  G  P  Y  E  Q  Y  F  G  P  G  T  R  L  T  V  T _                        
   Quality     666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666    
   Target0  90 TGTGCCAGTAGTCCCGGACAGGGTCCCTACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTC 179  Score
 TRBV19*00 427 tgtgccagtagt                                                                               438  450
  TRBD1*00  13                ggacaggg                                                                    20   40
TRBJ2-7*00  22                          cctacgagcagtacttcgggccgggcaccaggctcacggtcacag                     66   225

                                                                                       
                                                                                       
Quality     66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666    
Target0 180 CCACCCGAGGTCGTATCGCACAATGAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTAGATCTCGGTGGT 250  Score

At the end of the first line should be FR4>

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant