Rパッケージのインストールをmambaで行うように変更

README.rst

@@ -4,11 +4,6 @@ Name
 
 Overview
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-- !!! Rのパッケージバージョンを固定するためMicrosoft社が提供するCRANのスナップショットを利用していますが、2022年3月ころよりサーバが不安定となっているようです
-   - Rで以下エラーが出る場合は、この理由からコンテナの構築がうまくできていません
-   - ERROR: Error in dbConnect(PostgreSQL(), host = host, port = port, dbname = dbname, : could not find function "dbConnect"
-   - 数日様子を見ると復旧したりするので、Rでノックを行いたい場合は様子を見てコンテナを再構築してみてください
-   - SQL、Pythonには影響ありません。
 - データサイエンス100本ノック（構造化データ加工編）を実践するための演習問題とデータ、および環境構築のためのスクリプト一式
 - 演習問題はSQL、Python、Rで共通
 - 言語によっては向かない設問もあるが、「この言語のときはこう書けば実現できる」という技術習得を目指すことを優先

dockerfiles/notebook/Dockerfile

@@ -3,14 +3,15 @@ FROM jupyter/datascience-notebook:python-3.9.6
 USER root
 ENV DEBCONF_NOWARNINGS yes
 
+# mambaでR依存パッケージをインストール
+RUN mamba install --quiet --yes r-themis==0.1.4 r-rpostgresql==0.6_2
+
 # 最新のpostgresqlへの対応を行っている (参考: https://www.postgresql.org/download/linux/ubuntu/ )
 SHELL ["/bin/bash", "-o", "pipefail", "-c"]
 RUN apt-get update \
     && apt-get install -y --no-install-recommends lsb-release gnupg \
     && sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/repos/apt $(lsb_release -cs)-pgdg main" > /etc/apt/sources.list.d/pgdg.list' \
     && wget --quiet -O - https://www.postgresql.org/media/keys/ACCC4CF8.asc | apt-key add - \
-    && apt-get update \
-    && apt-get install -y --no-install-recommends libpq-dev \
     && apt-get remove -y lsb-release gnupg \
     && apt-get autoremove -y \
     && rm -rf /var/lib/apt/lists/*
@@ -22,5 +23,4 @@ COPY Pipfile.lock .
 
 RUN pip install --no-cache-dir pipenv==2021.5.29 \
     && pipenv install --system \
-    && rm Pipfile* \
-    && Rscript -e "install.packages(c('DBI', 'RPostgreSQL', 'themis'), dependencies = TRUE, error = TRUE, repos='https://cran.microsoft.com/snapshot/2021-10-05/')"
+    && rm Pipfile*